大多數病毒性心肌炎的患者經過適當的治療后,均能痊愈,少部分患者大約1個月左右會痊愈。大多數患者在1-3個月左右都會有痊愈,但部分患者會有心律失常,尤其是各型期前收縮,通常持續時間比較長,并且容易在感冒勞累后出現提前收縮增加的情況,癥狀也有所加重。房室傳導阻滯以及各型期前收縮也可以持續1年以上的時間。
如果沒有不適癥狀,可以不必使用抗心律失常藥物干預,少數患者經過數周或者數月的治療后,病情趨穩定,但可以留有一定程度的心臟擴大,心功能減退,伴有或不伴有心律失常或者是心電圖的異常,經久不愈,形成一些慢性的心肌炎。事實上,臨床很難與擴張型心肌病相鑒別,所以在疾病的后期,應注意自我防護。